1.遗传因素：
遗传因素造成的癫痫患病率为2%-6%，高于一般人群的0.5%~1%。
有部分癫痫综合征研究证明是有遗传性的，如青少年肌阵挛癫痫、良性家族性新生儿惊厥、常染色体显性夜间发作性额叶癫痫、进行性肌阵挛癫痫等。
但不是所有患者都有家族史，有的是患者基因自发突变。
2.脑结构性异常(先天或后天获得性)：
脑皮层发育异常、结节性硬化、脑肿瘤、脑外伤、脑血管病、缺血缺氧性脑病等。
3.感染性病因：
脑炎、脑脓肿、寄生虫感染(血吸虫、猪囊虫)。
4.免疫性病因：
如自身免疫性脑炎、狼疮脑病、桥本脑病等。
5.代谢性病因：
糖、脂肪、氨基酸、维生素、微量元素等代谢异常，如吡多醇依赖症、葡萄糖转运蛋白缺乏、低血糖、低血钙、苯丙酮尿症、尿毒症等。
6.病因不明：
目前的检查手段仍查不出明确病因。
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