一、概念上的区别
脑炎：是颅内感染主要侵犯脑实质引起的炎症。常见有病毒性脑炎、化脓性脑炎及脑脓肿、结核性脑炎及肉芽肿，较少见的有霉菌性脑炎及肉芽肿等。
脑膜炎：是颅内感染主要侵犯蛛网膜下腔引起的炎症。常见的有病毒性脑膜炎、化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎，较少见的有隐球菌性脑膜炎、梅毒性脑膜炎等。
脑膜脑炎：是指颅内感染同时侵犯了脑实质和蛛网膜下腔引起的炎症。常见的有病毒性脑膜脑炎、化脓性脑膜脑炎、结核性脑膜脑炎。
严格讲，没有绝对的脑炎，也没有绝对的脑膜炎。脑炎者一定伴有脑膜的炎性反应，脑膜炎者也一定伴有脑实质炎性反应，只是侧重点不同而已。
二、临床表现上的区别
发热、头痛是颅内炎症者最基本的临床表现。除此之外，各有特征。
脑炎者，常有不同程度的意识障碍或精神异常，可有定位体征，如肢体瘫痪、感觉障碍、癫痫发作等。脑膜刺激征相对较轻，可有巴氏征阳性。
脑膜炎者，明显的头疼、呕吐、颈项强直。意识保持清醒，无瘫痪、癫痫等脑实质损害的表现。巴氏征阴性。
脑膜脑炎者，上述表现均明显。
三、辅助检查上的区别
脑炎者，有中到重度的脑电图异常，主要表现为不同程度的慢波。脑脊液检查轻度异常或正常。
脑膜炎者，脑电图正常或轻度异常。脑脊液检查异常，表现为不同程度、不同比例的有核细胞增多，脑脊液糖、氯化物、蛋白异常。
脑膜脑炎者，脑电图和脑脊液均有明显异常。
脑CT和脑磁共振检查具有辅助诊断和鉴别诊断的价值。
四、脑脊液细胞学的区别
脑脊液细胞学检查是一种病理学检查手段，主要用于诊断珠网膜下腔的各种疾病。
病毒性脑膜炎主要表现为淋巴细胞反应模式，细菌性脑膜炎主要表现为中性粒细胞反应模式，结核性脑膜炎则主要表现为混合细胞反应模式。
脑膜炎的病原学检查阳性率低、周期长。而脑脊液细胞学检查常可在第一时间提示感染的性质，为及时治疗提供参考依据。
五、治疗
具体治疗用药应当依炎症的病原学而定，不管是哪一种炎症都应当足量足疗程用药。必要时辅助外科手术治疗。
六、目前存在的问题
医生和病人都误认为越贵的检查越有价值，只重视查CT和磁共振，忽略了脑电图和脑脊液这两项最基本最有价值的检查方法，从而延误了诊断，延误了病情。
新型病毒的岀现、耐药菌和变异菌的岀现、滥用抗生素等，使临床症状加重，辅助检查不典型，都给诊断和治疗带来极大的困难。
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